Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms