Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Odf1Q61999 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms