Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp2Q61990 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp2Q61990 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp2Q61990 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp2Q61990 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp2Q61990 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp2Q61990 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms