Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga6Q61739 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms