Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde1aQ61481 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde1aQ61481 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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