Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi1Q61474 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms