Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms