Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Foxd1Q61345 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd1Q61345 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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