Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd2Q61285 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd2Q61285 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms