Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc6Q61143 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc6Q61143 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms