Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf1Q61069 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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