Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms