Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grik1Q60934 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms