Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DbpQ60925 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms