Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Slc6a4Q60857 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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