Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ripk1Q60855 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms