Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mkrn3Q60764 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mkrn3Q60764 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms