Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd4Q60688 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms