Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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PtprnQ60673 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PtprnQ60673 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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