Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HnrnpdQ60668 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms