Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms