Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arcn1Q5XJY5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arcn1Q5XJY5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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