Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim38Q5SZ99 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim38Q5SZ99 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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