Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NacadQ5SWP3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NacadQ5SWP3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms