Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsr1Q5SWD9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms