Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc85aQ5SP85 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc85aQ5SP85 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms