Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trappc1Q5NCF2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms