Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SynaQ5G5D5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms