Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rtl5Q5DTT4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Rtl5Q5DTT4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl5Q5DTT4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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