Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam208bQ5DTT3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam208bQ5DTT3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms