Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eri2Q5BKS4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms