Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10488Q4KL05 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms