Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tigd5Q499M4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms