Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Smim26Q3V460 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim26Q3V460 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms