Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pydc3Q3V3Q4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms