Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ulk4Q3V129 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ulk4Q3V129 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms