Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc110Q3V125 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms