Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ankrd53Q3V0J4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ankrd53Q3V0J4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms