Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3V0E1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms