Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim80Q3V061 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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