Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prdm6Q3UZD5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prdm6Q3UZD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms