Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pfdn4Q3UWL8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn4Q3UWL8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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