Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim40Q3UWA4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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