Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms