Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Skap1Q3UUV5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skap1Q3UUV5 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms