Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230104I21RikQ3USW4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms