Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms