Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5460Q3UQ97 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5460Q3UQ97 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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