Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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