Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3UPC7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms